首先说下基础设定，新版ff7跟一些多重宇宙作品相似：
- 存在多个世界，每个选择都会产生新的分支
- 选择项不会造成非选择项分支消失，但游戏中有把可能性收束的概念
- 同一世界只能存在一个相同的人物，如果发生穿越，原先世界的人物就会消失
然后是7rb自创的规则：所谓的多世界或者多重宇宙，其实是星球创造的，是生命循环的一种形式，这些世界可以随意消亡，然后回归生命流再生，但要是星球死了，一切就完蛋了。这个设定决定了无论做多少选择，产生多少世界都不重要，重要的是人物的命运。而玩家们所在的世界是主世界（星球本体），其他世界是镜像，或者可以比喻成保护壳，所以最内层必须要保护好。
接下来说菲拉，目前为止菲拉的相关剧情比较谜语人，个人认为菲拉象征的是星球的意志，其行为目的是确保命运走向符合星球的利益，但是在remake结尾，萨菲罗斯似乎掌握了控制菲拉的能力，于是在7rb激活星球兵器时出现了白菲拉，应该是星球为抗衡萨菲罗斯创造的。黑菲拉和白菲拉并非完全对立，有时会出现行为一致的情况，比如两者都想让爱丽丝死掉。另外，菲拉，或者说星球的生命流力量，可以将人物传送到其他世界，因为其他世界也是星球创造的，有点像13机兵的扇区概念，所谓的传送，无非是像处理数据一样将生命放到另一个服务器而已。
下面就着以上设定谈故事，新版ff7的故事主要发生在两个世界中，一个是主角团所在的世界，简称世界A，也是星球主世界。一个是扎克斯所在的世界B，这个世界无足轻重。两部游戏的主干流程大致与原版一样，remake不同的地方是，比格斯和扎克斯活了下来。本该与雪崩成员一起死去的比格斯，和马琳一起被从世界A传送到世界B，扎克斯的传送起点未知，有可能是从随便一个世界X传到世界B的，世界B不是扎克斯原本所在的世界，因为7rb开头新闻有报道，主角团队团灭，唯独克劳德失踪了，扎克斯扶着克劳德穿越，导致世界B的克劳德消失。remake的另一个关键剧情是众人在结尾高速公路穿过命运之墙，导致爱丽丝的白魔石能量耗尽，变成空洞透明的魔晶石，爱丽丝因此变得跟og爱丽丝一样，失去了预知命运的能力。白魔石失去力量，也就意味着无法在终盘发动神圣术对抗陨石，星球已经危在旦夕，这是爱丽丝说的自由的代价。然后是7rb的剧情，游戏一开始，世界B的扎克斯救下昏迷的爱丽丝B，白魔石从发带掉落，可以看到这个世界的白魔石是充盈的。在7rb尾声，古代神殿崩塌后克劳德被传送到世界B，替换掉了昏迷在轮椅上的克劳德B。爱丽丝B唤醒克劳德，并在约会后将充盈白魔石交给克劳德，然后把他推回世界A，自己留了下来。这里有个概念，不同世界的爱丽丝，只要有白魔石力量的加持，都会掌握命运和星球知识，共享不同世界的信息。根据星球能源循环的设定，白魔石也属于星球能量的一部分，所以穿越其他世界带回白魔石是说得通的。克劳德将白魔石交给世界A的“爱丽丝”后（这里用了艺术表现手法，此处的爱丽丝应该是表现生命流传递白魔石的过程），想跟她一起走，但是被白菲拉阻挡。接下来就是让爱丽丝死掉，白魔石和爱丽丝沉入生命流，发动神圣的条件就全部具备了。这里先插入说说世界走向概念，也是这次7rb搞出的新花头。当初比格斯被传到世界B，让人感觉莫名其妙，全部打完感觉是菲拉调整扎克斯命运的一步棋。幸存下来的比格斯心情低落，满脑子还是想着对神罗复仇，最后独自一人跑去炸世界B魔晄炉，扎克斯看到比格斯的留言怕出事想去救，同时又想找宝条救昏迷的克劳德B，此时命运出现了分叉点。选择去神罗找宝条的扎克斯，被神罗士兵包围的扎克斯像以前那样一人迎战，最终战死。选择救比格斯的路线，扎克斯亲眼目睹了比格斯深陷命运泥沼再度死亡的结局，面对包围他的士兵，这次他果断改变想法选择跑路，活了下来。两个路线分支不会互斥，其中good ending路线会出现彩虹光晕，是最佳路线，但掌握黑菲拉能力随意穿越的萨菲罗斯正在逐渐扼杀这些可能性。而后，世界B的萨菲罗斯在爱丽丝教堂与扎克斯相遇，丢下一句：凭你，不足成事，一刀将扎克斯传走，这句话应该指他并不在意菲拉安排扎克斯活下来。世界B最后的结局是魔晄能源耗尽，没有生命流的白魔石无力对抗陨石，白魔石被转移到世界A，爱丽丝B被萨菲罗斯捅死，扎克斯被传送到世界A和克劳德一同对决萨菲罗斯。
回头说世界A的故事，众人来到遗忘之都，故事迎来决定爱丽丝生死的一幕，克劳德再一次抵抗命运，先是抵抗黑白菲拉联手，欲控制破坏剑斩向爱丽丝的举动，然后更是打破诅咒，挡下了萨菲罗斯刺向爱丽丝的命运一击！但此刻竟然同时出现了没成功挡下刀的bad ending分支，两种世界走向叠加在了一起，此时的克劳德和爱丽丝都处于叠加态，爱丽丝既是死的又是活的，克劳德则是叠加了救下和未救下爱丽丝的经历，但从同伴们的视角看，爱丽丝已经死了。出现这种现象可能跟萨菲罗斯说的世界交融，reunion概念有关。这里给tifa留了伏笔，因为先前tifa在科雷陆泡了生命流，导致她也有能力目睹叠加态现象，最后同伴们都走了，她还在湖边沉思，结局克劳德惊讶的发现黑魔石在自己手里，tifa也对克劳德有所戒备，这些伏笔会在下一部展开说。
总的来说，新版增加的剧情，是se尽可能在保留原作故事核心情节的前提下，弥补一些原作的遗憾。可以肯定的是，结局克劳德与爱丽丝的对话并不是脑子坏了，爱丽丝确实被救下来了，只是没有以肉身形态活着，不论是白魔石还是爱丽丝，都没有沉入生命流的展示，按理说神圣魔法是放不出来的，另外扎克斯下一部作为常驻队友存在也不是没可能，加上真假黑魔石，克劳德黑化等伏笔，第三部的原创内容比例应该会大幅增加，所以与其担心剧本还有没有爆点可说，不如担心se还敢不敢投这么多钱做最终章。以上都是个人看法，不一定对。